L'Isola Minore, come dice il nome stesso, con una superficie totale di 0,05 kmq è la più piccola isola del Lago Trasimeno. Dista solo 470 m dalla vicina Isola Maggiore ed è la più vicina a Passignano sul Trasimeno, territorio di cui fa parte.
L'Isola oggi disabitata è stata popolata per lungo tempo, fino al XV secolo, quando gli abitanti hanno deciso di spostarsi sulla terraferma. Oggi l'Isola è privata e non esistono collegamenti con i traghetti né un vero e proprio molo di attracco.
L'Isola, inoltre, Presenta una folta vegetazione boschiva, tra cui pini e lecci, e nutrita colonia di cormorani.