| | | Alto Bacino del Torrente Lama (IT5210073) | 2.349 ha |
| | | Ansa degli Ornari (IT5210025) | 198 ha |
| | | Bagno Minerale di Parrano (IT5220001) | 78 ha |
| | | Bassa Valnerina: Monte Fionchi - Cascata delle Marmore (IT5220025) | 6.044 ha |
| | | Boschi a Farnetto di Collestrada (IT5210077) | 78 ha |
| | | Boschi del Bacino di Gubbio (IT5210013) | 907 ha |
| | | Boschi dell'alta Valle del Nestore (IT5210040) | 2.826 ha |
| | | Boschi di Castel Rigone (IT5210016) | 866 ha |
| | | Boschi di Farnetta - Foresta fossile di Dunarobba (IT5220012) | 695 ha |
| | | Boschi di Ferretto - Bagnolo (IT5210020) | 1.917 ha |
| | | Boschi di Montebibico (IT5210069) | 201 ha |
| | | Boschi di Montelovesco - Monte delle Portole (IT5210012) | 1.961 ha |
| | | Boschi di Monti di Sodolungo - Rosso (IT5210001) | 2.597 ha |
| | | Boschi di Morra - Marzana (IT5210006) | 1.698 ha |
| | | Boschi di Pietralunga (IT5210004) | 1.488 ha |
| | | Boschi di Pischiello - Torre Civitella (IT5210017) | 1.314 ha |
| | | Boschi di Prodo - Corbara (IT5220004) | 2.635 ha |
| | | Boschi di Terne - Pupaggi (IT5210044) | 1.486 ha |
| | | Boschi e Brughiere di C. Farneto - P. Fiorello (IT5210029) | 326 ha |
| | | Boschi e Brughiere di Panicarola (IT5210028) | 142 ha |
| | | Boschi e Pascoli di Fratticciola Selvatica (IT5210075) | 2.313 ha |
| | | Boschi Sereni - Torricella (IT5210033) | 258 ha |
| | | Bosco dell'Elmo (IT5220003) | 946 ha |
| | | Cascata delle Marmore (IT5220017) | 87 ha |
| | | Castagneti di Morro (IT5210079) | 27 ha |
| | | Col Falcone (IT5210031) | 134 ha |
| | | Colli Selvalonga - Il Monte (IT5210023) | 473 ha |
| | | Colline Premartane tra Bettona e Gualdo Cattaneo (IT5210078) | 2.624 ha |
| | | Fiume e Fonti del Clitunno (IT5210053) | 18 ha |
| | | Fiume Menotre (IT5210041) | 56 ha |
| | | Fiume Tescio (IT5210022) | 63 ha |
| | | Fiume Tevere tra Monte Molino e Pontecuti (IT5210054) | 153 ha |
| | | Fiume Tevere tra S. Giustino - Pierantonio (IT5210003) | 483 ha |
| | | Fiume Timia tra Bevagna e Cannara (IT5210039) | 53 ha |
| | | Fiume Topino (IT5210024) | 41 ha |
| | | Fiume Vigi (IT5210045) | 108 ha |
| | | Fosso dell' Eremo delle Carceri (IT5210030) | 50 ha |
| | | Fosso della Vallaccia - Monte Pormaiore (IT5210019) | 629 ha |
| | | Fosso di Camposolo (IT5210057) | 509 ha |
| | | Fosso Salto del Cieco (IT5220015) | 497 ha |
| | | Gola del Corno - Stretta di Biselli (IT5210055) | 1.245 ha |
| | | Gola del Corno Di Catria (IT5210005) | 598 ha |
| | | Gola del Forello (IT5220006) | 237 ha |
| | | Gole di Narni - Stifone (IT5220020) | 203 ha |
| | | Laghetto e Piani di Gavelli (IT5210068) | 105 ha |
| | | Lago dell'Aia (IT5220019) | 101 ha |
| | | Lago dell'Aia (IT5220027) | 233 ha |
| | | Lago di Alviano (IT5220011) | 730 ha |
| | | Lago di Corbara (IT5220005) | 880 ha |
| | | Lago di Piediluco - Monte Caperno (IT5220018) | 413 ha |
| | | Lago di Piediluco - Monte Maro (IT5220026) | 969 ha |
| | | Lago di S. Liberato (IT5220022) | 306 ha |
| | | Lago Trasimeno (IT5210018) | 12.864 ha |
| | | Lago Trasimeno (IT5210070) | 14.503 ha |
| | | Le Gorghe (IT5210010) | 116 ha |
| | | Lecceta di Sassovivo (IT5210042) | 628 ha |
| | | Marcite di Norcia (IT5210059) | 29 ha |
| | | Media Val Casana (IT5210066) | 487 ha |
| | | Monte Alago (IT5210076) | 68 ha |
| | | Monte Cucco (IT5210009) | 879 ha |
| | | Monte il Cerchio (IT5210060) | 1.579 ha |
| | | Monte la Pelosa - Colle Fergiara (IT5220016) | 750 ha |
| | | Monte Maggio (IT5210062) | 828 ha |
| | | Monte Malbe (IT5210021) | 983 ha |
| | | Monte Solenne (IT5220010) | 831 ha |
| | | Monte Subasio (IT5210027) | 1.130 ha |
| | | Monte Torre Maggiore (IT5220013) | 1.472 ha |
| | | Monteluco di Spoleto (IT5210064) | 486 ha |
| | | Monti Amerini (IT5220008) | 6.476 ha |
| | | Monti Coscerno - Civitella - Aspra (IT5210063) | 5.344 ha |
| | | Monti Galloro - dell'Immagine (IT5210058) | 1.462 ha |
| | | Monti Lo Stiglio - Pagliaro (IT5210056) | 1.011 ha |
| | | Monti Maggio - Monte Nero (IT5210014) | 1.592 ha |
| | | Monti Marzolana - Montali (IT5210026) | 747 ha |
| | | Monti Pizzuto - Alvagnano (IT5210067) | 1.396 ha |
| | | Monti S. Pancrazio - Oriolo (IT5220023) | 1.278 ha |
| | | Monti Serano - Brunette (IT5210047) | 1.878 ha |
| | | Monti Sibillini (IT5210071) | 17.696 ha |
| | | Palude di Colfiorito (IT5210034) | 156 ha |
| | | Palude di Colfiorito (IT5210072) | 179 ha |
| | | Piani di Annifo - Arvello (IT5210032) | 221 ha |
| | | Piani di Ruschio (IT5220021) | 360 ha |
| | | Piano di Ricciano (IT5210036) | 102 ha |
| | | Poggio Caselle - Fosso Renaro (IT5210035) | 300 ha |
| | | Poggio Pantano (IT5210074) | 33 ha |
| | | Roccaporena - Monte della Sassa (IT5210065) | 271 ha |
| | | Sasso di Pale (IT5210038) | 242 ha |
| | | Selva di Cupigliolo (IT5210037) | 232 ha |
| | | Selva di Meana (IT5220002) | 2.490 ha |
| | | Serre di Burano (IT5210002) | 714 ha |
| | | Sorgiva dell'Aiso (IT5210043) | 1 ha |
| | | Torrente Argentina (IT5210049) | 10 ha |
| | | Torrente Naia (IT5210061) | 120 ha |
| | | Torrente Vetorno (IT5210011) | 66 ha |
| | | Valle del Rio Freddo (IT5210008) | 64 ha |
| | | Valle del Tevere tra i Laghi Corbara - Alviano (IT5220024) | 7.118 ha |
| | | Valle del Torrente Nese (IT5210015) | 510 ha |
| | | Valle del Torrente Serra (IT5220014) | 1.021 ha |
| | | Valle delle Prigioni (IT5210007) | 611 ha |
| | | Valle di Campiano (IT5210048) | 56 ha |
| | | Valle di Pettino (IT5210050) | 796 ha |
| | | Valle Pasquarella (IT5220007) | 513 ha |
| | | Valnerina (IT5210046) | 673 ha |
